根據《財政部?交通運輸部?稅務總局關于海南自由貿易港國際運輸船舶有關增值稅政策的通知》（財稅〔2020〕41號）、《財政部?交通運輸部?稅務總局關于中國（上海）自由貿易試驗區(qū)臨港新片區(qū)國際運輸船舶有關增值稅政策的通知》（財稅〔2020〕52號）規(guī)定，稅務總局制定了《國際運輸船舶增值稅退稅管理辦法》，現(xiàn)予以發(fā)布。
特此公告。
國家稅務總局
2020年12月2日
國際運輸船舶增值稅退稅管理辦法
第一條?為規(guī)范國際運輸船舶增值稅退稅管理，根據《財政部?交通運輸部?稅務總局關于海南自由貿易港國際運輸船舶有關增值稅政策的通知》（財稅〔2020〕41號）、《財政部?交通運輸部?稅務總局關于中國（上海）自由貿易試驗區(qū)臨港新片區(qū)國際運輸船舶有關增值稅政策的通知》（財稅〔2020〕52號）規(guī)定，制定本辦法。
第二條?運輸企業(yè)購進符合財稅〔2020〕41號文件第一條或者財稅〔2020〕52號文件第一條規(guī)定條件的船舶，按照本辦法退還增值稅（以下簡稱“船舶退稅”）。
應予退還的增值稅額，為運輸企業(yè)購進船舶取得的增值稅專用發(fā)票上注明的稅額。
第三條?主管運輸企業(yè)退稅的稅務機關（以下簡稱“主管稅務機關”）負責船舶退稅的備案、辦理及后續(xù)管理工作。
第四條?適用船舶退稅政策的運輸企業(yè)，應于首次申報船舶退稅時，憑以下資料及電子數(shù)據向主管稅務機關辦理船舶退稅備案：
（一）內容填寫真實、完整的《出口退（免）稅備案表》及其電子數(shù)據。該備案表由《國家稅務總局關于出口退（免）稅申報有關問題的公告》(2018年第16號)發(fā)布。其中，“是否提供零稅率應稅服務”填寫“是”；“提供零稅率應稅服務代碼”填寫“01（國際運輸服務）”；“出口退（免）稅管理類型”填寫“船舶退稅運輸企業(yè)”；其他欄次按填表說明填寫。
（二）運輸企業(yè)從事國際運輸和港澳臺運輸業(yè)務的證明文件。從事國際散裝液體危險貨物和旅客運輸業(yè)務的，應當提供交通運輸管理部門出具的《國際船舶運輸經營許可證》復印件(復印件上應注明“與原件一致”，并加蓋企業(yè)公章，下同)；從事國際集裝箱和普通貨物運輸?shù)?，應提供交通運輸管理部門的備案證明材料復印件。從事內地往返港澳散裝液體危險貨物和旅客運輸業(yè)務的，應提供交通運輸管理部門出具的批準文件復印件；從事內地往返港澳集裝箱和普通貨物運輸?shù)模瑧峁┙煌ㄟ\輸管理部門出具的備案證明材料復印件；從事大陸與臺灣地區(qū)間運輸?shù)?，應提供《臺灣海峽兩岸間水路運輸許可證》及《臺灣海峽兩岸間船舶營運證》復印件。
上述資料運輸企業(yè)可通過電子化方式提交。
第五條?本辦法施行前，已辦理出口退（免）稅備案的運輸企業(yè)，無需重新辦理出口退（免）稅備案，按照本辦法第四條規(guī)定辦理備案變更即可。
運輸企業(yè)適用船舶退稅政策的同時，出口貨物勞務或者發(fā)生增值稅零稅率跨境應稅行為，且未辦理過出口退（免）稅備案的，在辦理出口退（免）稅備案時，除本辦法第四條規(guī)定的資料外，還應按照現(xiàn)行規(guī)定提供其他相關資料。
第六條?運輸企業(yè)備案資料齊全，《出口退（免）稅備案表》填寫內容符合要求，簽字、印章完整的，主管稅務機關應當予以備案。備案資料或填寫內容不符合要求的，主管稅務機關應一次性告知運輸企業(yè)，待其補正后再予以備案。??
第七條?已辦理船舶退稅備案的運輸企業(yè)，發(fā)生船籍所有人變更、船籍港變更或不再從事國際運輸（或港澳臺運輸）業(yè)務等情形，不再符合財稅〔2020〕41號文件、財稅〔2020〕52號文件退稅條件的，應自條件變化之日起30日內，持相關資料向主管稅務機關辦理備案變更。自條件變更之日起，運輸企業(yè)停止適用船舶退稅政策。
未按照本辦法規(guī)定辦理退稅備案變更并繼續(xù)申報船舶退稅的，主管稅務機關應按照本辦法第十四條規(guī)定進行處理。
第八條?運輸企業(yè)船舶退稅的申報期限，為購進船舶之日（以發(fā)票開具日期為準）次月1日起至次年4月30日前的各增值稅納稅申報期。
第九條?運輸企業(yè)在退稅申報期內，憑下列資料及電子數(shù)據向主管稅務機關申請辦理船舶退稅：
（一）財稅〔2020〕41號文件第三條第1項、第2項規(guī)定的資料復印件，或者財稅〔2020〕52號文件第三條第1項、第2項規(guī)定的資料復印件。其中，已向主管稅務機關提供過的資料，如無變化，可不再重復提供。
（二）《購進自用貨物退稅申報表》及其電子數(shù)據。該表在《國家稅務總局關于發(fā)布〈出口貨物勞務增值稅和消費稅管理辦法〉的公告》(2012年第24號)發(fā)布。填寫該表時，應在業(yè)務類型欄填寫“CBTS”,備注欄填寫“船舶退稅”。
（三）境內建造船舶企業(yè)開具的增值稅專用發(fā)票及其電子信息。
（四）主管稅務機關要求提供的其他資料。
上述增值稅專用發(fā)票，應當已通過增值稅發(fā)票綜合服務平臺確認用途為“用于出口退稅”。上述資料運輸企業(yè)可通過電子化方式提交。
第十條?運輸企業(yè)申報船舶退稅，主管稅務機關經審核符合規(guī)定的，應按規(guī)定及時辦理退稅。審核中發(fā)現(xiàn)疑點，主管稅務機關應在確認運輸企業(yè)購進船舶取得的增值稅專用發(fā)票真實、發(fā)票所列船舶已按規(guī)定申報納稅后，方可辦理退稅。
第十一條?運輸企業(yè)購進船舶取得的增值稅專用發(fā)票，已用于進項稅額抵扣的，不得申報船舶退稅；已用于船舶退稅的，不得用于進項稅額抵扣。
第十二條?已辦理增值稅退稅的船舶發(fā)生船籍所有人變更、船籍港變更或不再從事國際運輸（或港澳臺運輸）業(yè)務等情形，不再符合財稅〔2020〕41號文件、財稅〔2020〕52號文件退稅條件的，運輸企業(yè)應在條件變更次月納稅申報期內，向主管稅務機關補繳已退稅款。未按規(guī)定補繳的，稅務機關應當按照現(xiàn)行規(guī)定追回已退稅款。
應補繳稅款＝購進船舶的增值稅專用發(fā)票注明的稅額×（凈值÷原值）
凈值＝原值-累計折舊
第十三條?已辦理增值稅退稅的船舶發(fā)生船籍所有人變更、船籍港變更或不再從事國際運輸（或港澳臺運輸）業(yè)務等情形，不再符合財稅〔2020〕41號文件、財稅〔2020〕52號文件規(guī)定，并已經向主管稅務機關補繳已退稅款的運輸企業(yè)，自取得完稅憑證當期起，可憑從稅務機關取得解繳稅款的完稅憑證，從銷項稅額中抵扣完稅憑證上注明的增值稅額。
第十四條?運輸企業(yè)采取提供虛假退稅申報資料等手段，騙取船舶退稅的，主管稅務機關應追回已退稅款，并依照《中華人民共和國稅收征收管理法》有關規(guī)定處理。
第十五條?本辦法未明確的其他退稅管理事項，按照現(xiàn)行出口退（免）稅相關規(guī)定執(zhí)行。
第十六條?符合財稅〔2020〕41號文件規(guī)定情形且《船舶所有權登記證書》的簽發(fā)日期在2020年10月1日至2024年12月31日期間的運輸企業(yè)，以及符合財稅〔2020〕52號文件規(guī)定情形且《船舶所有權登記證書》的簽發(fā)日期在2020年11月1日至2024年12月31日期間的運輸企業(yè)，按照本辦法辦理船舶退稅相關事項。
