根據(jù)《財(cái)政部?交通運(yùn)輸部?稅務(wù)總局關(guān)于海南自由貿(mào)易港國(guó)際運(yùn)輸船舶有關(guān)增值稅政策的通知》（財(cái)稅〔2020〕41號(hào)）、《財(cái)政部?交通運(yùn)輸部?稅務(wù)總局關(guān)于中國(guó)（上海）自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)臨港新片區(qū)國(guó)際運(yùn)輸船舶有關(guān)增值稅政策的通知》（財(cái)稅〔2020〕52號(hào)）規(guī)定，稅務(wù)總局配套制發(fā)了《國(guó)際運(yùn)輸船舶增值稅退稅管理辦法》（以下簡(jiǎn)稱(chēng)《辦法》）?，F(xiàn)解讀如下：
一、《辦法》出臺(tái)的背景
為支持海南自由貿(mào)易港、上海自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)臨港新片區(qū)建設(shè)，財(cái)政部會(huì)同交通運(yùn)輸部、稅務(wù)總局先后制發(fā)了《關(guān)于海南自由貿(mào)易港國(guó)際運(yùn)輸船舶有關(guān)增值稅政策的通知》（財(cái)稅〔2020〕41號(hào)）和《關(guān)于中國(guó)（上海）自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)臨港新片區(qū)國(guó)際運(yùn)輸船舶有關(guān)增值稅政策的通知》（財(cái)稅〔2020〕52號(hào)），明確對(duì)國(guó)際運(yùn)輸企業(yè)自境內(nèi)建造船舶企業(yè)購(gòu)買(mǎi)、在海南洋浦港、上海洋山港登記的船舶，實(shí)行增值稅退稅政策（以下簡(jiǎn)稱(chēng)“船舶退稅”）。為確保船舶退稅政策落地，稅務(wù)總局制發(fā)了《辦法》，就船舶退稅的備案、辦理及后續(xù)管理等問(wèn)題予以明確。
二、《辦法》的主要內(nèi)容解讀
（一）適用《辦法》的具體范圍
《辦法》第二條明確，運(yùn)輸企業(yè)購(gòu)進(jìn)符合財(cái)稅〔2020〕41號(hào)文件第一條、財(cái)稅〔2020〕52號(hào)文件第一條規(guī)定條件的船舶，按照《辦法》辦理船舶退稅。
（二）如何確定船舶退稅的退稅額？
《辦法》第二條明確，船舶退稅退還的增值稅額，為運(yùn)輸企業(yè)購(gòu)進(jìn)船舶取得的增值稅專(zhuān)用發(fā)票上注明的稅額。
（三）適用船舶退稅政策的運(yùn)輸企業(yè)，如何辦理船舶退稅備案？
《辦法》第四條明確，適用船舶退稅政策的運(yùn)輸企業(yè)，應(yīng)于首次申報(bào)船舶退稅時(shí)，憑以下資料向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理船舶退稅備案：一是內(nèi)容填寫(xiě)真實(shí)、完整的《出口退（免）稅備案表》及其電子數(shù)據(jù)。二是運(yùn)輸企業(yè)從事國(guó)際運(yùn)輸或港澳臺(tái)運(yùn)輸業(yè)務(wù)的證明文件復(fù)印件。同時(shí)，為便利企業(yè)，《辦法》明確，上述資料運(yùn)輸企業(yè)可通過(guò)電子化方式提交。
（四）適用船舶退稅政策的運(yùn)輸企業(yè)，在填寫(xiě)《出口退（免）稅備案表》時(shí)，有什么需要特別注意的地方？
《辦法》第四條明確，適用船舶退稅政策的運(yùn)輸企業(yè)在填寫(xiě)《出口退（免）稅備案表》時(shí)，應(yīng)在“是否提供零稅率應(yīng)稅服務(wù)”欄次填寫(xiě)“是”；“提供零稅率應(yīng)稅服務(wù)代碼”欄次填寫(xiě)“01（國(guó)際運(yùn)輸服務(wù)）”；“出口退（免）稅管理類(lèi)型”欄次填寫(xiě)“船舶退稅運(yùn)輸企業(yè)”；其他欄次按填表說(shuō)明填寫(xiě)。
（五）此前未辦理過(guò)出口退（免）稅備案的運(yùn)輸企業(yè)，如在適用船舶退稅政策的同時(shí)，還開(kāi)展了貨物勞務(wù)出口業(yè)務(wù)，應(yīng)當(dāng)如何辦理出口退（免）稅備案？
《辦法》第五條明確，適用船舶退稅政策的運(yùn)輸企業(yè)同時(shí)出口貨物勞務(wù)、且未辦理過(guò)出口退（免）稅備案的，除船舶退稅備案所需資料外，還應(yīng)按現(xiàn)行規(guī)定提供加蓋備案登記專(zhuān)用章的《對(duì)外貿(mào)易經(jīng)營(yíng)者備案登記表》或《中華人民共和國(guó)外商投資企業(yè)批準(zhǔn)證書(shū)》，以及《中華人民共和國(guó)海關(guān)報(bào)關(guān)單位注冊(cè)登記證書(shū)》等相關(guān)資料。
（六）已辦理船舶退稅備案的運(yùn)輸企業(yè)，不再?gòu)氖聡?guó)際運(yùn)輸業(yè)務(wù)的，是否需要向稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理備案變更手續(xù)？如何辦理？
需要辦理?！掇k法》第七條明確，已辦理船舶退稅備案的運(yùn)輸企業(yè)，發(fā)生船籍所有人變更、船籍港變更或不再?gòu)氖聡?guó)際運(yùn)輸（或港澳臺(tái)運(yùn)輸）業(yè)務(wù)等不符合財(cái)稅〔2020〕41號(hào)、財(cái)稅〔2020〕52號(hào)文件規(guī)定的退稅條件的，須自條件變更之日起30日內(nèi)，持相關(guān)資料向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理備案變更，并自條件變更之日起，停止享受船舶退稅政策。
（七）適用船舶退稅政策的運(yùn)輸企業(yè)，應(yīng)當(dāng)如何申報(bào)辦理船舶退稅？
《公告》第九條明確，運(yùn)輸企業(yè)向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)辦理船舶退稅時(shí),提供下列資料及電子信息:一是財(cái)稅〔2020〕41號(hào)、財(cái)稅〔2020〕52號(hào)文件第三條第1項(xiàng)、第2項(xiàng)規(guī)定的資料復(fù)印件。其中，此前已向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)提供過(guò)的資料，如無(wú)變化，企業(yè)無(wú)需重復(fù)提供。二是《購(gòu)進(jìn)自用貨物退稅申報(bào)表》及其電子信息，并在該表業(yè)務(wù)類(lèi)型欄填寫(xiě)“CBTS”，備注欄填寫(xiě)“船舶退稅”。三是境內(nèi)建造船舶企業(yè)開(kāi)具的增值稅專(zhuān)用發(fā)票及其電子信息。四是主管稅務(wù)機(jī)關(guān)要求提供的其他資料。同時(shí)，為便利企業(yè)，《辦法》明確，上述資料運(yùn)輸企業(yè)可通過(guò)電子化方式提交。
（八）運(yùn)輸企業(yè)在申報(bào)船舶退稅時(shí)，需要提供境內(nèi)建造船舶企業(yè)開(kāi)具的增值稅專(zhuān)用發(fā)票，對(duì)于上述發(fā)票有什么特別要求？
《辦法》第九條明確，運(yùn)輸企業(yè)購(gòu)進(jìn)船舶的增值稅專(zhuān)用發(fā)票，應(yīng)當(dāng)已通過(guò)增值稅發(fā)票綜合服務(wù)平臺(tái)確認(rèn)用途為“用于出口退稅”。
（九）已辦理船舶退稅備案的運(yùn)輸企業(yè)，發(fā)生船籍所有人變更、船籍港變更或不再?gòu)氖聡?guó)際運(yùn)輸（或港澳臺(tái)運(yùn)輸）業(yè)務(wù)等不符合財(cái)稅〔2020〕41號(hào)、財(cái)稅〔2020〕52號(hào)文件規(guī)定情形的，是否需要補(bǔ)繳已退稅款？
需要補(bǔ)繳?！掇k法》第十二條明確，已退稅船舶發(fā)生船籍所有人變更、船籍港變更或不再?gòu)氖聡?guó)際運(yùn)輸（或港澳臺(tái)運(yùn)輸）業(yè)務(wù)等不符合財(cái)稅〔2020〕41號(hào)、財(cái)稅〔2020〕52號(hào)文件規(guī)定的退稅條件的，運(yùn)輸企業(yè)應(yīng)當(dāng)在條件變更次月的納稅申報(bào)期內(nèi)，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理補(bǔ)繳已退稅款手續(xù)。應(yīng)補(bǔ)繳稅款按以下公式計(jì)算得出：
應(yīng)補(bǔ)繳稅款＝購(gòu)進(jìn)船舶的增值稅專(zhuān)用發(fā)票注明的稅額×（凈值÷原值）
凈值＝原值-累計(jì)折舊
（十）運(yùn)輸企業(yè)發(fā)生騙取船舶退稅等違法違規(guī)行為的，應(yīng)當(dāng)如何處理？
《辦法》第十四條明確，運(yùn)輸企業(yè)發(fā)生騙取船舶退稅的，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)追回已退稅款，并依照稅收征管法的有關(guān)規(guī)定處理。
三、執(zhí)行期限
財(cái)稅〔2020〕41號(hào)文件明確，海南船舶退稅政策的施行期限為2020年10月1日至2024年12月31日，財(cái)稅〔2020〕52號(hào)文件明確，上海船舶退稅政策的施行期限為2020年11月1日至2024年12月31日，施行期限均以《船舶所有權(quán)登記證書(shū)》的簽發(fā)日期為準(zhǔn)。根據(jù)上述規(guī)定，《辦法》發(fā)布后，凡是《船舶所有權(quán)登記證書(shū)》簽發(fā)日期在上述政策施行期間的，均可按《辦法》申請(qǐng)船舶退稅。
鏈接：《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于發(fā)布<國(guó)際運(yùn)輸船舶增值稅退稅管理辦法>的公告》（國(guó)家稅務(wù)總局公告2020年第18號(hào)）
